问题背景
GROMACS 能否使用 GPU,取决于编译选项和运行时环境。只安装 CUDA 并不代表 mdrun 会自动走 GPU。
适用环境
适用于 NVIDIA GPU 分子模拟工作站或服务器。
安装步骤
- TODO:确认驱动和 CUDA。
- TODO:规划是否启用 MPI。
- TODO:用 CMake 记录编译参数。
- TODO:加载 GMXRC。
验证命令
TODO:记录 gmx --version、gmx mdrun 测试和 GPU 识别输出。
常见错误
包括 CUDA 不被 CMake 发现、MPI 版本混用、GMXRC 未加载。
解决方法
先确认 gmx --version 中的 GPU support,再进行 benchmark。
服务入口
HPCSoft.cn 可提供 GROMACS GPU 配置与测试服务。
免责声明
测试结果受硬件、体系和编译参数影响。