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GROMACS GPU 安装前的 CUDA 与 MPI 检查

梳理 GROMACS GPU 环境中驱动、CUDA、MPI、CMake 和 mdrun 验证的基本步骤。

更新:2026-05-24 · 分类:GROMACS · 难度:中等

问题背景

GROMACS 能否使用 GPU,取决于编译选项和运行时环境。只安装 CUDA 并不代表 mdrun 会自动走 GPU。

适用环境

适用于 NVIDIA GPU 分子模拟工作站或服务器。

安装步骤

  1. TODO:确认驱动和 CUDA。
  2. TODO:规划是否启用 MPI。
  3. TODO:用 CMake 记录编译参数。
  4. TODO:加载 GMXRC。

验证命令

TODO:记录 gmx --versiongmx mdrun 测试和 GPU 识别输出。

常见错误

包括 CUDA 不被 CMake 发现、MPI 版本混用、GMXRC 未加载。

解决方法

先确认 gmx --version 中的 GPU support,再进行 benchmark。

服务入口

HPCSoft.cn 可提供 GROMACS GPU 配置与测试服务。

免责声明

测试结果受硬件、体系和编译参数影响。