LAMMPS MPI 并行计算环境重建

本案例面向一台完成系统重装后的科研计算服务器。服务器原先用于 LAMMPS 分子模拟计算，但重装后原有软件路径、MPI 环境和运行脚本均不可用。

我们根据用户保留的输入文件和历史脚本，重新配置 LAMMPS MPI 并行环境，并通过单核与多核测试算例完成运行验证。

该服务器主要用于课题组内部的分子模拟任务。用户已有一批 LAMMPS 输入文件和历史运行习惯，但缺少原始环境的完整编译记录。

在重装系统后，用户无法直接判断问题来自 LAMMPS、MPI、编译器还是运行脚本。若直接重新安装软件而不做运行验证，后续仍可能出现并行运行失败或结果不可复现的问题。

本项目以“恢复可运行并行计算环境”为目标，而不是简单安装一个 LAMMPS 可执行文件。我们先确认系统、编译器、MPI 和依赖库，再重新构建 LAMMPS 所需模块。

随后根据用户原有脚本调整 lmp 路径、mpirun 参数和运行目录，并用单核与多核测试算例分别验证，确保环境不仅能启动，还能按预期完成并行计算。

本项目解决的不是“安装一个 LAMMPS”，而是“让用户已有计算任务重新回到可运行、可验证、可交接的状态”。

对于长期使用 LAMMPS 的课题组来说，系统重装、服务器迁移或环境丢失都可能导致历史脚本不可用。通过重建并记录完整运行环境，可以降低后续维护成本。

该方案也适用于其它依赖 MPI 的科研软件环境重建，关键是把编译环境、运行脚本和测试算例一起作为交付内容。