技术文档

Codex 与 COMSOL 脚本自动化：从手动建模到可复现批量仿真

结合 COMSOL Java API、Model Methods、LiveLink for MATLAB 和 batch 运行方式，说明如何让 Codex 辅助脚本生成、参数扫描、结果导出和仿真流程复现。

更新：2026-06-03 · 中等

Codex 与 Ansys 自动化：用脚本整理仿真流程，而不是反复手动操作

说明 Codex 如何配合 PyAnsys、PyMAPDL、PyFluent、Workbench Journal 和 Mechanical 脚本，用于参数化建模、批量求解、结果导出和仿真流程复现。

更新：2026-06-03 · 中等

OpenMPI、MPICH、Intel MPI 不要在同一个软件里混用

解释 MPI 编译器包装器、运行器、动态库和 ABI 混用导致的问题，并给出排查命令。

更新：2026-06-01 · 中等

LAMMPS 的 GPU package 与 KOKKOS：编译前应先确定的几件事

从驱动、CUDA、编译器、MPI、GPU 架构和测试算例几个层面梳理 LAMMPS GPU/KOKKOS 编译前的检查项。

更新：2026-06-01 · 较难

CUDA 环境排查时要分清 Driver、Runtime、Toolkit 和编译器

解释 NVIDIA Driver、CUDA Runtime、CUDA Toolkit、nvcc、GCC 与目标软件之间的关系，并给出一套可复现的排查记录方法。

更新：2026-06-01 · 中等

为什么 nvidia-smi 显示 CUDA 12.8，而我装的是 CUDA 13.0？CUDA 版本兼容机制详解

nvidia-smi 显示的 CUDA Version 是驱动支持的最高 Runtime 版本，nvcc --version 才是实际 Toolkit 版本。本文解析两者区别、Toolkit 与驱动的最低版本匹配关系，以及不匹配时 LAMMPS/GROMACS GPU 出现 PTX 编译失败、段错误的原因与避免方法。

更新：2025-11-22 · 中等

单节点 Slurm 配置：为什么先把资源模型写清楚

说明单节点服务器部署 Slurm 前需要确认的主机名、CPU、内存、GPU、Munge、分区和作业验收命令。

更新：2026-06-01 · 中等

你的服务器关掉超线程了吗？一文教你设置 AMD SMT（超线程）

SMT（超线程）是什么、HPC 为什么通常建议关闭、AMD（技嘉主板）BIOS 中 SMT Control 的设置位置，以及用 nproc / lscpu 在 Linux 下验证 SMT 是否开启。

更新：2026-05-20 · 入门

Rocky Linux 8.10（GNOME）全局集成 OVITO

在 Rocky/Alma/RHEL 8 上把 OVITO Basic 安装到 /usr/local 并用版本链接管理，安装 Qt/xcb 运行依赖，系统范围集成到 GNOME（应用菜单、图标、文件类型关联、右键脚本），并给出升级/回滚/卸载与常见 Qt xcb、Wayland、远程 X11 问题的排查。

更新：2025-11-15 · 中等

Linux 下用 ip 命令查看 IP、网卡、子网掩码与网关

iproute2 的 ip 命令速查：用 ip -br -c addr/link 看清网卡与地址，用 ip route/ip neigh 理清路径与邻居，临时配置 IP/网关/MTU/VLAN/桥接，以及在 Netplan/NetworkManager 中永久化。

更新：2025-11-10 · 入门

Linux 下使用 useradd / adduser 创建用户

总结 RockyLinux、CentOS、Ubuntu 下 useradd 与 adduser 的区别、常见用户创建方式、UID/GID 与附加组配置，以及“无输出即成功”的验证方法。

更新：2025-08-26 · 入门

为什么以及如何将 Ubuntu 默认 Shell 从 dash 改为 bash

解析 Ubuntu 为何将 /bin/sh 默认指向 dash、bashisms 带来的脚本兼容问题，以及用 dpkg-reconfigure 安全切换 /bin/sh 到 bash 的步骤。

更新：2025-08-14 · 入门

VASPKIT 简介及预编译版本安装说明

VASPKIT 是面向 VASP 的高效后处理工具，覆盖能带、态密度、电荷、功函数与介电性质。本文介绍其功能要点，并给出服务器/超算上普通用户手动离线部署（上传 ~/software、安装到 ~/opt）的步骤与常用命令。

更新：2025-10-12 · 入门

GAP-20（Carbon）数据包与 dpdata 转 DeepMD 数据集

解析 Carbon_GAP_20.tgz 与单独训练数据文件的区别、extxyz 数据格式特征，以及用 dpdata 将 GAP-20 训练数据转换为 DeepMD（deepmd/npy）格式时 virial 标签不一致、MultiSystems 等典型报错的根因与可复现解决流程。

更新：2025-09-20 · 中等

CUDA driver/runtime version mismatch 怎么排查

解释 CUDA 驱动、runtime、Toolkit 和 Python 包自带 CUDA 库之间的错配关系。

运行程序时报 libmpi.so 找不到

从动态链接、MPI 混用、LD_LIBRARY_PATH 和 module 加载顺序排查 libmpi.so 缺失问题。

Slurm 节点进入 drain 状态时先看 Reason

说明 sinfo -R、scontrol show node、slurmd 日志和资源配置不一致导致 drain 的排查顺序。

LAMMPS 安装后命令找不到：先确认可执行文件名和 PATH

排查 lmp、lmp_mpi、lammps 等命令不可用时的安装路径、环境变量和 shell 初始化问题。

OpenSM 日志撑满根分区：从 326GB opensm.log 到 deleted 文件句柄

一次 InfiniBand OpenSM 日志暴涨导致根分区占满的排查记录，包含 df/du 不一致、lsof +L1、文件句柄释放、日志级别治理和 logrotate 防复发。

Slurm 任务秒失败：slurmd 启动后退出，定位到内核升级导致 NVIDIA 驱动失效（/dev/nvidia0 缺失）

slurmd 启动即退出、作业秒失败，前台 slurmd -Dvvv 暴露 Waiting for gres.conf /dev/nvidia0；根因是内核升级后 NVIDIA 模块未重建（UVM 因 MPOL_PREFERRED_MANY 宏冲突编译失败）。给出回滚内核、DKMS 根治、GRES 临时止血三种方案与验证闭环。